Jezioro stanowi południowy basen kompleksu jeziora Mamry. Długie jest na 8,5 km i na 3 km szerokie, w najgłębszym miejscu ma ok. 25 metrów. Woda w jeziorze zakwalifikowana jest do II klasy czystości. Jezioro jest typu leszczowego, występujące w nim ryby to: leszcz, płoć, szczupak, okoń. Kisajno jest najintensywniej użytkowanym jeziorem pod względem turystyczno-rekreacyjnym w północnej części Wielkich Jezior.
Na południu poprzez kanał Piękna Góra Kisajno Łączy się z jeziorem Tajty. Na południowym wschodzie, w niewielkiej zatoce Tracz znajduje się wejście do Kanału Łuczyńskiego, który prowadzi bezpośrednio na jezioro Niegocin.
Południowa części jeziora stanowi archipelag różnej wielkości wysp, które sprawiają, że Kisajno wydaje się o wiele mniejsze niż w rzeczywistości. Płynąc z jeziora Tracz torem wodnym mijamy w kolejności: Duży Ostrów, Sosnowy Ostrów Wronie Kępy, Światowy Ostrów, w głębi Górny Ostrów i Czaplę, dalej Wielką Kiermuzę i Dębową Górkę. Wszystkie wyspy są objęte ochroną rezerwatową, ponieważ na wyspach żerują liczne gatunki ptaków wodnych.
Część jeziora leżąca pomiędzy wyspami, a zachodnim brzegiem nosi nazwę Łabędziego Szlaku. Znalezienie go wcale nie jest Łatwe. Wąski przesmyk prowadzi pomiędzy rozgałęzioną wyspą Duży Ostrów a półwyspem Ostrów Mały. Przesmyk znajduje się w odległości ok. kilometra na północny zachód od główek kanału Piękna Góra
Północna część jeziora od wysokości półwyspu Sarni i Olchowy Róg ma zupełnie inny charakter. Woda rozlewa się tu szeroko. Brzeg wschodni tworzy potężny półwysep Fulda, wchodzący klinem pomiędzy jezioro Kisajno a jezioro Dobskie.
Brzeg zachodni to w większości teren bezleśny. Na północy od Olchowego Rogu tworzy półokrągłą zatokę, w głębi której widać domy i fabryczny komin wsi Perkunowo. Zatoka jest jednak bardzo płytka, co utrudnia dostęp do wsi. Granica z jeziorem Dargin przebiega na wysokości Królewskiego i Wysokiego Rogu, ale jest trudna do uchwycenia, bo na północnym krańcu Kisajno ma 2,5 km szerokości.

4 km - Giżycko / Fortyfikacje i umocnienia - Twierdza Boyen w Giżycku
5 km - Giżycko / punkty widokowe - Punkt widokowy – Krzyż Brunona
5 km - Giżycko / Ciekawostki myśli technicznej - Most Obrotowy w Giżycku
5 km - Gizycko / Zamki, ruiny - Zamek krzyzacki w Giżycku
6 km - Giżycko / klasztory, kościoły - Kościół Ewangelicki w Giżycku
7 km - Pieczarki / góry, jeziora, rzeki - Jezioro Dargin
7 km - Giżycko / Ciekawostki myśli technicznej - Wieża ciśnień w Giżycku
7 km - Giżycko / punkty widokowe - Punkt widokowy – wieża ciśnień w Giżycku
8 km - Giżycko / góry, jeziora, rzeki - Jezioro Niegocin
9 km - Sztynort / Pałace, dwory - Sztynort - pałac Lehndorffów
217 km - Szałkowo / Inne imprezy - XV Spotkania z Folklorem - Festiwal Folklorystyczny w Szałkowie
215 km - Siemiany / Koncerty - VII Festiwal "Nad Jeziorakiem" Siemiany 2012
16 km - Węgorzewo / Koncerty - Seven Festival Węgorzewo 2012
209 km - Rudzienice / Jarmarki i turnieje rycerskie - Jarmark Ludowy w Rudzienicach
46 km - Krutyń / Inne imprezy - Wycieczka autokarowa do Mazurskiego Parku Krajobrazowego
45 km - Mrągowo / Inne imprezy - Spływ kajakowy rzeką Dajną
2 km - Pierkunowo / Domki letniskowe
6 km - Giżycko / Apartamenty
7 km - Giżycko / Kwatery prywatne
9 km - Kirsajty / Agroturystyka
9 km - Kamionki / Agroturystyka
9 km - Harsz / Domki letniskowe
10 km - Giżycko / Kwatery prywatne
10 km - Dziewiszewo / Pensjonaty
10 km - Rydzewo / Apartamenty
10 km - Rydzewo / Campingi pola namiotowe
