Renesans jest tym stylem w polskiej architekturze sakralnej, w którym zachowało się dużo mniej zabytków niż np. świątyń gotyckich lub barokowych. Jest tak zapewne dlatego, że odrodzenie (renesans) było okresem o wiele krótszym od średniowiecza przeciągającego się przez ponad 3 stulecia, podczas gdy renesans trwał niespełna lat 150.
Kościół klarysek w Bydgoszczy jest w całości późnorenesansowy, chociaż prezbiterium ma jeszcze korzenie późnogotyckie, dlatego później nadano temu pezbiterium cechy renesansowe.
Budowa obecnego kościoła murowanego rozpoczęła się w 1582 roku, w miejscu wcześniejszego kościoła drewnianego. W 1591 roku mieszczanin bydgoski Grzegorz Gracza przeznacza testamentalnie fundusze na budowę kaplicy bocznej, której budowę ukończono w 1602roku.
W 1614 roku Zofia z Potulickich Rozdrażewska wojewodzina kaliska, Andrzej Rozdrażewski i Kasper Zebrzydowski podejmują starania o zezwolenie na założenie klasztoru klarysek, które zatwierdza papież Paweł V w roku 1615, ustanawiając pierwszą przełożoną Zofię Annę z Rozdrażewa Smuszewską.
W 1636 roku ukończono budowę kościoła klasztornego i nastąpiła jego konsekracja oraz nadanie wezwania św. Klary i św. Barbary. Siostry klaryski mieszkały w Bydgoszczy ponad 200 lat, bo w 1834 roku władze pruskie przejęły klasztor i kościół i dokonały jego sekularyzacji. Siostry zakonne musiały opuścić miasto. Ponowne przekazanie świątyni na cele sakralne nastąpiło dopiero w 1920 roku, a jego ponowna konsekracja po remoncie kościoła nastąpiła w 1922 roku.
W okresie okupacji hitlerowskiej kościół był nieczynny. W latach powojennych przeprowadzono w kościele szereg prac konserwatorskich. Renesansowy kościół klarysek jest niewielki więc jego wyposażenie nie jest szczególne imponujące, ale jest bardzo cenne,ma wysoki poziom artystyczny i pochodzi z różnych epok. Najcenniejszy jest renesansowy ołtarz główny i renesansowy strop kasetonowy nawy.
Inne cenne zabytki wyposażenia to np. kute barokowe kraty, pająki - gotycki i barokowe, płyty nagrobne renesansowe i barokowe. Ciekawostką jest to, że znany i ceniony malarz Leon Wyczółkowski podarował swój cenny obraz św. Stanisława Kostki właśnie kościołowi klarysek w Bydgoszczy. Obraz ten wisi wysoko na południowej ścianie nawy.
Kościół klarysek jest po katedrze bydgoskiej i kościele pobernardyńskim najstarszym i najcenniejszym zabytkiem w Bydgoszczy.

0,9 km - Bydgoszcz / Zabudowa miejska - Secesyjny gmach Uniwersytetu im. Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy
0,9 km - Bydgoszcz / klasztory, kościoły - Katedra w Bydgoszczy
0,9 km - Bydgoszcz / Zabudowa miejska - Klasycystyczny budynek Biblioteki im.Witolda Bełzy w Bydgoszczy
0,9 km - Bydgoszcz / Zabudowa miejska - Wielkomiejska architektura Bydgoszczy z końca XIX wieku
0,9 km - Bydgoszcz / Pomniki, obeliski, tablice pamiątkowe - Przechodzący przez rzekę
14 km - Chmielniki Bydgoskie / góry, jeziora, rzeki - Jezioro Jezuickie,akwen na skraju Puszczy Bydgoskiej
20 km - Ostromecko / Pałace, dwory - Zespół pałacowo-parkowy w Ostromecku
21 km - Koronowo / klasztory, kościoły - Kościół pocysterski w Koronowie
24 km - Koronowo / góry, jeziora, rzeki - Jezioro Koronowskie
25 km - Lubostroń / Pałace, dwory - Pałac Lubostroń
118 km - Biskupin / Wystawy - CASTRUM ET MONASTERIUM Wielka, zapomniana historia grodu i klasztoru cysterskiego w Łeknie.
118 km - Biskupin / Inne imprezy - Pokazy starożytnych technik
43 km - Bożejewiczki k/Żnina / Zawody sportowe - Otwarte zawody western i rodeo
118 km - Biskupin / Inne imprezy - Zabawa dla całej Rodziny !
118 km - Biskupin / Inne imprezy - Planuj z nami Dzień Dziecka
40 km - Żnin / Koncerty - RECITAL HALINY KUNICKIEJ
48 km - Cierpice k. Torunia / Hotele
54 km - Kruszwica / Pensjonaty
72 km - Powidz / Agroturystyka
81 km - Ciechocinek / Kwatery prywatne
85 km - Zblewo / Agroturystyka
88 km - LICHEŃ STARY / Kwatery prywatne
111 km - Zgorzałe / Agroturystyka
130 km - Otomin / Pensjonaty
132 km - Poznań / Apartamenty
132 km - Poznań / Kwatery prywatne
